Įmonės pradininkė Danutė Ivanauskienė šakočius pradėjo kepti nuo 1975 metų, ko išmoko iš savo mamytės bei močiutės. 1991.02.01 buvo įregistruota Individuali Danutės Ivanauskienės šakočių kepimo įmonė. Nuo pat pradžių įmonė specializavosi tik šakočių gamyboje, jokių kitų gaminių nekepė.
2006.02.01 įmonė buvo pertvarkyta į UAB „Danutės šakotis“. 2011.03.07 UAB „Danutės šakotis“ gavo tautinio paveldo sertifikatą iš Lietuvos Respublikos Žemės Ūkio Ministerijos, kuris patvirtino, kad šakočiai kepami, laikantis tradicijų ir nekeičiant receptūros. Gaminio receptas perduodamas iš kartos į kartą. Tai yra jau trečia karta užsiimanti šakočių kepimo verslu ir tikimasi, jog bus perduotas ketvirtai kartai, nes Danutės Ivanauskienės sūnus taip pat dirba įmonėje. Taipogi šiuo sertifikatu įmonė yra įpareigota ir laiko savo tikslu nekeisti gaminio kepimo proceso ir recepto bei išlaikyti aukštą produkto kokybę.